Berdasarkan Keputusan Rektor IAIB Serang Nomor 105/A.1/IAIB/IX/2015 tahun 2015 Tentang Susunan Organisasi IAIB Serang, terdiri atas:

1. Dewan Penyantun
2. Senat Institut
3. Rektor dan Wakil Rektor
4. Biro Administrasi Umum, Akademik, dan Kemahasiswaan (AUAK)
5. Satuan Pemeriksa Internal (SPI)
6. Pelaksana Akademik
   1. Fakultas-fakultas;Lembaga Penelitian;
   1. Lembaga Pengabdian kepada Masyarakat.
7. Pelaksana Teknis
   1. Pusat Penjaminan Mutu;Pusat Perpustakaan;Lembaga Bahasa;
   1. Pusat Komputer.
8. Unsur Kelengkapan (dibentuk sesuai dengan kebutuhan dan ditetapkan dengan Surat Keputusan Rektor)